Les Institutions internationales
L'AMREF travaille en partenariat étroit avec
- Les grandes agences de l'ONU : FAO, UNESCO, FMI, Banque Mondiale, OMS, AID
- Les programmes et fonds de l'ONU : PAM, UNICEF, PNUD
- Le Global Fund/Fonds Mondial de lutte contre le Sida, la tuberculose et le paludisme : soutient un programme de lutte contre le HIV/Sida en Tanzanie.
- Le programme RBM (Roll Back Malaria) : l'AMREF représente les ONG de santé au Board du RBM.
- L'Union Européenne soutient les tournées médicales des Flying Doctors et finance 1 programme de lutte contre la malaria en Tanzanie et un programme de lutte contre le trachome en Ethiopie.
Les institionnels français
La MAAIONG, la DAH, l'AESN.